量化理论计算探究薁(azulene)的反Kasha规则荧光机制

根据Kasha规则,由于高激发态之间存在快速的无辐射跃迁,分子的荧光或磷光的初始状态是最低的单重态或三重态。薁(azulene)是典型违反 Kasha 规则的例子。azulene的荧光来自于S2态,可以认为是由于S2→S1能隙比较大,所以降低了S2→S1内转换速率。另外,由于S1和S0之间的能隙相对较小,所以其内转换速率很大,从而降低了S1→S0的荧光量子效率,所以S1→S0的荧光很难被发现。这里以具有反常荧光现象的azulene为例,使用BDF软件和MOMAP软件,计算azulene的S1→S0的辐射速率和内转换速率,从而解释azulene第一激发态极低的量子效率导致其荧光难以被观测到的实验结果。

MOMAP对azulene的S1→S0的辐射速率和内转换速率的计算需要BDF量化软件的结构优化频率结果文件、非绝热耦合结果文件和参数部分都已完成。首先完成量化软件BDF的计算部分。

BDF计算部分

准备azulene分子结构的xyz文件如下:

18

C                 -0.48100000    0.74480000    0.00000000
C                 -0.56240000   -0.71320000    0.00020000
C                 -1.75790000    1.17860000   -0.00030000
C                 -1.96510000   -1.08880000    0.00000000
C                  0.66870000    1.60890000    0.00030000
C                  0.45100000   -1.58850000    0.00030000
C                 -2.66930000    0.05180000   -0.00010000
C                  1.95140000    1.22210000    0.00020000
C                  1.86730000   -1.29960000   -0.00020000
C                  2.49720000   -0.11610000   -0.00040000
H                 -2.09080000    2.20560000   -0.00040000
H                 -2.35750000   -2.09240000    0.00010000
H                  0.46620000    2.67860000    0.00070000
H                  0.22090000   -2.65340000    0.00040000
H                 -3.74370000    0.14050000   -0.00030000
H                  2.70720000    2.00650000    0.00050000
H                  2.49320000   -2.19150000   -0.00060000
H                  3.58670000   -0.13930000   -0.00080000

打开Device studio,点击File-new project,命名为 fluorescence.hpf ,将 azulene.xyz 拖入Project中,双击 azulene.hzw ,得到如图所示界面。

../_images/fig5.1-1.png

首先使用BDF进行azulene的结构优化和频率计算。选中Simulator → BDF → BDF,界面中设置参数。在Basic Settings界面中的Calculation Type选择Opt+Freq,方法采用默认的GB3LYP泛函,基组在Basis中的All Electron类型中,选择6-31G(d,p)。Basic Settings界面中的其它参数以及SCF Settings、OPT Settings、Freq Settings等面板的参数使用推荐的默认值,不需要做修改。之后点击 Generate files 即可生成对应计算的输入文件。

../_images/fig5.1-2.png

选中生成的 bdf.inp 文件,右击选择open with,打开该文件,如下所示:

$compass
Title
C10H8
Geometry
C -0.48100000 0.74480000 0.00000000
C -0.56240000 -0.71320000 0.00020000
C -1.75790000 1.17860000 -0.00030000
C -1.96510000 -1.08880000 0.00000000
C 0.66870000 1.60890000 0.00030000
C 0.45100000 -1.58850000 0.00030000
C -2.66930000 0.05180000 -0.00010000
C 1.95140000 1.22210000 0.00020000
C 1.86730000 -1.29960000 -0.00020000
C 2.49720000 -0.11610000 -0.00040000
H -2.09080000 2.20560000 -0.00040000
H -2.35750000 -2.09240000 0.00010000
H 0.46620000 2.67860000 0.00070000
H 0.22090000 -2.65340000 0.00040000
H -3.74370000 0.14050000 -0.00030000
H 2.70720000 2.00650000 0.00050000
H 2.49320000 -2.19150000 -0.00060000
H 3.58670000 -0.13930000 -0.00080000
End Geometry
Basis
6-31G(d,p)
Skeleton
Group
C(1)
$end

$bdfopt
Solver
1
MaxCycle
108
IOpt
3
Hess
final
$end

$xuanyuan
Direct
$end

$scf
RKS
Charge
0
SpinMulti
1
DFT
GB3LYP
D3
MPEC+COSX
Molden
$end

$resp
Geom
$end

选中 bdf.inp 文件,右击选择Run,弹出如下界面:

../_images/fig5.1-3.png

点击Run提交作业,会自动弹出结果文件的实时输出。

../_images/fig5.1-4.png

任务结束后 bdf.outbdf.out.tmpbdf.scf.molden 三个结果文件会出现在Project中。

../_images/fig5.1-5.png

选择 bdf.out ,右击show view,在Optimization对话框中,显示结构已经达到收敛标准。

../_images/fig5.1-6.png

在Frequency对话框中,检查频率,若不存在虚频证明结构已经优化到极小点。

../_images/fig5.1-7.png

在Summary对话框中,Total Energy为-385.87807600 a.u.,为需要的基态azulene的单点能。

../_images/fig5.1-8.png

点击Job Manager中该计算任务,点击服务器,已经进入到了该任务所在文件夹下,输入 /data/hzwtech/DS-BDF_2022A/sbin/optgeom2xyz.py bdf.optgeom ,回车,生成 bdf.xyz 文件。点击文件传输工具,进入文件夹下,将 bdf.xyz 文件拖出,即为下一步激发态结构优化需要的输入文件。改名为 azulene_s0.xyz ,打开文件夹,将第二行描述行去掉,拖入Device Studio中。

使用BDF进行azulene的S1激发态结构优化和频率计算。选中Simulator → BDF → BDF,界面中设置参数。在Basic Settings界面中的Calculation Type选择TDDFT-OPT+Freq,方法采用默认的GB3LYP泛函,基组在Basis中的All Electron类型中,选择6-31G(d,p)。SCF Settings和TDDFT Settings面板中将Use MPEC+COSX Acceleraton的默认勾选去掉。Basic Settings、SCF Settings、TDDFT Settings界面中的其它参数以及OPT Settings、Freq Settings等面板的参数使用推荐的默认值,不需要做修改。之后点击 Generate files 即可生成对应计算的输入文件。

../_images/fig5.1-9.png
../_images/fig5.1-10.png
../_images/fig5.1-11.png

选中生成的 bdf.inp 文件,右击选择open with,打开该文件,如下所示:

$compass
Title
C10H8
Geometry
C 0.79273796 0.49102542 -0.00003307
C -0.70229649 0.61186591 0.00000000
C 1.30022932 1.80163337 -0.00006272
C -0.99262499 1.98726800 0.00007812
C 1.54415132 -0.67887418 0.00000000
C -1.63318173 -0.42094563 -0.00002837
C 0.21877157 2.69859813 0.00000000
C 1.10656346 -2.00562676 0.00005788
C -1.41619168 -1.80093044 -0.00004814
C -0.20258112 -2.49333483 0.00000000
H 2.35092512 2.06249889 -0.00009828
H -1.98777600 2.41348149 0.00017650
H 2.62424717 -0.53731745 0.00001117
H -2.67585843 -0.10561277 -0.00001521
H 0.30641472 3.77916915 0.00002386
H 1.88966566 -2.75951313 0.00017581
H -2.31053950 -2.41870505 -0.00009019
H -0.29054446 -3.57807510 0.00000000
End Geometry
Basis
6-31G(d,p)
Skeleton
Group
C(1)
$end

$bdfopt
Solver
1
MaxCycle
108
IOpt
3
Hess
final
$end

$xuanyuan
Direct
$end

$scf
RKS
Charge
0
SpinMulti
1
DFT
GB3LYP
D3
Molden
$end

$tddft
Imethod
1
Isf
0
Idiag
1
Iroot
6
Istore
1
$end

$resp
Geom
Method
2
Nfiles
1
Iroot
1
$end

选中 bdf.inp 文件,右击选择Run提交作业,任务结束后 bdf.outbdf.out.tmpbdf.scf.molden 三个结果文件会出现在Project中。

选择 bdf.out ,右击show view,在Optimization对话框中,显示结构已经达到收敛标准。

../_images/fig5.1-12.png

在Frequency对话框中,检查频率,若不存在虚频证明结构已经优化到极小点。

../_images/fig5.1-13.png

选择 bdf.out.tmp ,右击open with containing folder,打开 bdf.out.tmp ,在文件开始向下查找第一个tddft计算模块 module tddft 。根据tddft模块的 Ground to excited state Transition electric dipole moments (Au) 中的State 1的跃迁电偶极矩,得到momap需要的参数EDMA,计算方法为: \(\sqrt{(0.3456)^2+(-0.1159)^2+(-0.0000)^2}\) = 0.3646 a.u.。需要将单位a.u.转换为Debye,因此EDMA= 0.3646*2.5417=0.9267 Debye。

*** Ground to excited state Transition electric dipole moments (Au) ***
   State          X           Y           Z          Osc.
      1       0.3456      -0.1159       0.0000       0.0079       0.0079
      2       0.0538       0.1576       0.0000       0.0025       0.0025
      3      -0.6407       0.2166       0.0000       0.0527       0.0527
      4       0.9123       2.7142       0.0000       1.0366       1.0366
      5      -0.0001       0.0002       0.0200       0.0001       0.0001
      6      -1.2021       0.4024      -0.0000       0.2383       0.2383

在文件末尾向上查找第一个tddft计算模块 module tddft 。根据tddft模块的 Ground to excited state Transition electric dipole moments (Au) 中的State 1的跃迁电偶极矩,得到momap需要的参数EDME,计算方法为: \(\sqrt{(-0.2427)^2+(0.0816)^2+(-0.0000)^2}\) = 0.2560 a.u.。需要将单位a.u.转换为Debye,因此EDMA= 0.3646*2.5417=0.6507 Debye。

*** Ground to excited state Transition electric dipole moments (Au) ***
State          X           Y           Z          Osc.
   1      -0.2427       0.0816       0.0000       0.0026       0.0026
   2       0.0403       0.1199       0.0000       0.0013       0.0013
   3      -0.2655       0.0888      -0.0000       0.0090       0.0090
   4      -0.8679      -2.5831       0.0000       0.8696       0.8696
   5      -1.2356       0.4150       0.0000       0.2404       0.2404
   6      -0.0008       0.0003       0.0006       0.0000       0.0000

在该 tddft 模块的 Statistics for [dvdson_rpa_block]: 中读取No. 1态的能量为 -385.8030480568 a.u.,即为S1态的单点能。

    ------------------------------------------------------------------
 Statistics for [dvdson_rpa_block]:
  No.  of blocks =        1
  Size of blocks =       50
  No.  of eigens =        6
  No.  of HxProd =       73      Averaged =    12.167
  Eigenvalues (a.u.) =
       0.0593694732        0.1241240214        0.1718082072
       0.1756634611        0.2122947029        0.2131964457
------------------------------------------------------------------


No.     1    w=      1.6155 eV     -385.8030480568 a.u.  f=    0.0026   D<Pab>= 0.0000   Ova= 0.4881
     CV(0):    A(  33 )->   A(  36 )  c_i: -0.1361  Per:  1.9%  IPA:     5.454 eV  Oai: 0.7151
     CV(0):    A(  34 )->   A(  35 )  c_i: -0.9847  Per: 97.0%  IPA:     2.582 eV  Oai: 0.4815

No.     2    w=      3.3776 eV     -385.7382935086 a.u.  f=    0.0013   D<Pab>= 0.0000   Ova= 0.8097
     CV(0):    A(  33 )->   A(  35 )  c_i: -0.6839  Per: 46.8%  IPA:     4.083 eV  Oai: 0.8197
     CV(0):    A(  34 )->   A(  36 )  c_i:  0.7092  Per: 50.3%  IPA:     3.953 eV  Oai: 0.8078

No.     3    w=      4.6751 eV     -385.6906093228 a.u.  f=    0.0090   D<Pab>= 0.0000   Ova= 0.7195
     CV(0):    A(  32 )->   A(  35 )  c_i:  0.5413  Per: 29.3%  IPA:     5.770 eV  Oai: 0.7332
     CV(0):    A(  33 )->   A(  36 )  c_i:  0.8170  Per: 66.7%  IPA:     5.454 eV  Oai: 0.7151
     CV(0):    A(  34 )->   A(  38 )  c_i:  0.1417  Per:  2.0%  IPA:     7.164 eV  Oai: 0.7494

No.     4    w=      4.7800 eV     -385.6867540689 a.u.  f=    0.8696   D<Pab>= 0.0000   Ova= 0.7950
     CV(0):    A(  32 )->   A(  36 )  c_i:  0.1707  Per:  2.9%  IPA:     7.141 eV  Oai: 0.8644
     CV(0):    A(  33 )->   A(  35 )  c_i: -0.6794  Per: 46.2%  IPA:     4.083 eV  Oai: 0.8197
     CV(0):    A(  33 )->   A(  38 )  c_i:  0.1022  Per:  1.0%  IPA:     8.665 eV  Oai: 0.8000
     CV(0):    A(  34 )->   A(  36 )  c_i: -0.6312  Per: 39.8%  IPA:     3.953 eV  Oai: 0.8078

No.     5    w=      5.7768 eV     -385.6501228271 a.u.  f=    0.2404   D<Pab>= 0.0000   Ova= 0.7166
     CV(0):    A(  31 )->   A(  36 )  c_i: -0.1797  Per:  3.2%  IPA:     8.008 eV  Oai: 0.7623
     CV(0):    A(  32 )->   A(  35 )  c_i: -0.7750  Per: 60.1%  IPA:     5.770 eV  Oai: 0.7332
     CV(0):    A(  33 )->   A(  36 )  c_i:  0.4518  Per: 20.4%  IPA:     5.454 eV  Oai: 0.7151
     CV(0):    A(  34 )->   A(  38 )  c_i:  0.1740  Per:  3.0%  IPA:     7.164 eV  Oai: 0.7494
     CV(0):    A(  34 )->   A(  40 )  c_i: -0.2680  Per:  7.2%  IPA:     8.035 eV  Oai: 0.6274

No.     6    w=      5.8014 eV     -385.6492210843 a.u.  f=    0.0000   D<Pab>= 0.0000   Ova= 0.4336
     CV(0):    A(  29 )->   A(  35 )  c_i:  0.9969  Per: 99.4%  IPA:     7.064 eV  Oai: 0.4335

将S1态的单点能与S0态的单点能相减,即得momap需要的两态的能量差参数Ead=0.07502 a.u.。

基于基态结构,做S0和S1之间的非绝热耦合计算。点击 azulene_s0.hzw ,右击点击copy,设置new file name为nacme,在Project中出现 nacme.hzw 。双击 nacme.hzw ,使用BDF进行azulene的非绝热耦合计算。选中Simulator → BDF → BDF,界面中设置参数。在Basic Settings界面中的Calculation Type选择TDDFT-NAC, 方法采用默认的GB3LYP泛函,基组在Basis中的All Electron类型中,选择6-31G(d,p)。SCF Settings和TDDFT Settings面板中将Use MPEC+COSX Acceleraton的默认勾选去掉。在TDDFT Settings面板中的Non-Adiabatic Coupling内容框中,在默认的Coupling between Ground and Excited-State下,点击”+”号,Basic Settings、 SCF Settings、TDDFT Settings界面中的其它参数以及OPT Settings、Freq Settings等面板的参数使用推荐的默认值,不需要做修改。之后点击 Generate files 即可生成对应计算的输入文件。

../_images/fig5.1-14.png
../_images/fig5.1-15.png

选中生成的 bdf.inp 文件,右击选择open with,打开该文件,如下所示:

$compass
Title
C10H8
Geometry
C 0.79273796 0.49102542 -0.00003306
C -0.70229648 0.61186591 0.00000000
C 1.30022931 1.80163336 -0.00006271
C -0.99262499 1.98726799 0.00007812
C 1.54415131 -0.67887417 0.00000000
C -1.63318173 -0.42094562 -0.00002837
C 0.21877157 2.69859812 0.00000000
C 1.10656346 -2.00562675 0.00005788
C -1.41619168 -1.80093044 -0.00004813
C -0.20258112 -2.49333482 0.00000000
H 2.35092512 2.06249888 -0.00009827
H -1.98777599 2.41348149 0.00017649
H 2.62424717 -0.53731744 0.00001117
H -2.67585843 -0.10561277 -0.00001520
H 0.30641472 3.77916915 0.00002385
H 1.88966565 -2.75951312 0.00017580
H -2.31053950 -2.41870504 -0.00009018
H -0.29054446 -3.57807510 0.00000000
End Geometry
Basis
6-31G(d,p)
Skeleton
Group
C(1)
$end

$xuanyuan
Direct
$end

$scf
RKS
Charge
0
SpinMulti
1
DFT
GB3LYP
D3
MPEC+COSX
Molden
$end

$tddft
Imethod
1
Isf
0
Idiag
1
Iroot
6
Istore
1
$end

$resp
Quad
FNAC
Norder
1
Method
2
Nfiles
1
Single
States
1
1 1 1
$end

选中 bdf.inp 文件,右击选择Run提交作业,任务结束后 bdf.outbdf.scf.molden 三个结果文件会出现在Project中。

至此,MOMAP对azulene的S1→S0的辐射速率和内转换速率的计算需要的BDF量化软件的结构优化频率结果文件、非绝热耦合结果文件和参数部分都已完成。

MOMAP计算部分

在使用量化软件BDF完成azulene的基态和激发态的结构优化、频率计算以及非绝热耦合的计算,并计算完momap输入文件中需要的参数后,接下来将使用MOMAP软件对azulene的S1→S0的辐射速率和内转换速率进行计算,通过对比辐射速率和内转换速率来解释azulene的S1→S0的荧光难以被观测到的原因。

首先计算S1→S0的荧光辐射速率,第一步为做电子振动耦合(electron-vibration coupling, EVC)计算,该计算基于量化计算输出的分子振动频率、力常数矩阵,同时在内坐标以及直角坐标系下,计算分子跃迁发生初末态间的模式位移、黄昆因子、重整能以及Duschinsky转动矩阵。 将bdf的S0优化频率计算结果改为 zulene-s0.out ,将S1的计算结果改为 azulene-s1.out ,同时放在EVC计算文件夹中。 EVC计算的输入文件 momap.inp 为:

do_evc          = 1

&evc
  ffreq(1)      = "azulene-s0.out"
  ffreq(2)      = "azulene-s1.out"
  proj_reorg = .t.
/

提交脚本文件 momap.slurm ,任务运行结束后,生成如下文件

../_images/fig5.2-1.png

其中 evc.cart.dat 为利用直角坐标系计算得到的模式位移、黄昆因子、重整能以及 Duschinsky 转动矩阵的结果;而 evc.dint.dat 为内坐标计算模式位移、黄昆因子、重整能,直角坐标计算Duschinsky转动矩阵的结果。

打开 evc.cart.dat 文件,查看总重整能的数值:

--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  Total reorganization energy      (cm-1):         4032.869339       5126.265767
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

并与 evc.dint.dat 文件中的数值进行比较:

--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  Total reorganization energy      (cm-1):         4070.407661       5114.173064
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

比较 evc.cart.dat 以及 evc.dint.dat 文件内的重整能,若重整能相差不大(< \(1000 cm^{-1}\) ),使用 evc.cart.dat 文件进行后续计算,若重整能相差较大(一般情况 evc.cart.dat 大于 evc.dint.dat ),使用 evc.dint.dat 文件进行后续计算。这里两者较为接近,且数值较为合理(< \(10000 cm^{-1}\) ),可使用 evc.cart.dat 进行下一步S1→S0的荧光辐射速率计算。

此外,还可以根据EVC计算的结果文件做更多的后处理。

evc.dx.x.comevc.dx.x.xyz 为两个电子态分子叠加图,其中 evc.dx.x.com 可用GaussView打开,在View-Display Format-Molecule中选择Tube类型,显示如下:

../_images/fig5.2-2.png

evc.dx.x.xyz 可用Jmol软件打开,显示如下:

../_images/fig5.2-3.png

evc.dx.v.xyz 也是分子态叠加图,用Jmol软件打开,选择显示-矢量-0.1A,显示如下:

../_images/fig5.2-4.png

evc.cart.abs 为Duschinsky矩阵文件,可用来画Duschinsky矩阵二维图。可以在Device Studio中,选择Simulator-momap-analysis,打开 evc.cart.abs 文件,显示如下:

../_images/fig5.2-5.png

同样的方法打开 evc.dint.abs 文件,可在ColorType下拉选框选择显示颜色,显示如下:

../_images/fig5.2-6.png

Duschinsky矩阵都是用直角坐标计算的,二者选一即可。

evc.vib1.xyzevc.vib2.xyz 文件与 evc.cart.dat 文件放在同一路径下,在Device Studio中,选择Simulator-momap-analysis,打开 evc.cart.dat 文件,出现基态和激发态下各个振动模式对应的重整能和黄昆因子图,显示如下:

../_images/fig5.2-7.png
../_images/fig5.2-8.png
../_images/fig5.2-9.png
../_images/fig5.2-10.png

点击Choose Color可以改变线的颜色,改变Set Width中的数值可改变线的粗细。点击图中的线,右侧结构将展示相应的振动模式。振动的快慢可通过Animation Frequency调整,振动的幅度可根据Displacement Amplitude显示。

接下来进行S1→S0的荧光光谱及荧光辐射速率的计算。此部分计算需要EVC计算所得的 evc.*.dat 文件作为输入。如前所述,将 evc.cart.dat 放在荧光光谱及荧光辐射速率的计算文件中,输入文件 momap.inp 为:

do_spec_tvcf_ft   = 1
do_spec_tvcf_spec = 1

&spec_tvcf
  DUSHIN        = .t.
  Temp          = 300 K
  tmax          = 1000 fs
  dt            = 1   fs
  Ead           = 0.07502 au
  EDMA          = 0.9267 debye
  EDME          = 0.6507 debye
  FreqScale     = 0.70
  DSFile        = "evc.cart.dat"
  Emax          = 0.3 au
  dE            = 0.00001 au
  logFile       = "spec.tvcf.log"
  FtFile        = "spec.tvcf.ft.dat"
  FoFile        = "spec.tvcf.fo.dat"
  FoSFile       = "spec.tvcf.spec.dat"
/

提交脚本文件 momap.slurm ,任务计算结束后,生成文件如下所示:

../_images/fig5.2-11.png

spec.tvcf.ft.dat为关联函数文件,内容如下:

#F(t) file
    #time(fs)        abs_FC_Re        abs_FC_Im        emi_FC_Re        emi_FC_Im
  -1000.00000 -3.222659695E-06 -3.680115014E-05 -3.738401821E-06  1.830624064E-05
   -999.00000 -1.314545717E-05 -4.054982998E-05 -1.645610065E-07  1.674654956E-05
   -998.00000 -2.552186539E-05 -3.557857053E-05  1.690265080E-06  1.428576477E-05
   -997.00000 -3.030022340E-05 -2.305671104E-05  2.187359504E-06  1.222900063E-05
   -996.00000 -2.620263828E-05 -1.307399386E-05  2.137378198E-06  1.094934359E-05
   -995.00000 -1.984646799E-05 -8.898814274E-06  2.126481370E-06  1.032271509E-05
   -994.00000 -1.480939587E-05 -8.192889658E-06  2.544875562E-06  9.992907379E-06
   -993.00000 -1.150600369E-05 -8.808752896E-06  3.437467322E-06  9.316576838E-06
   -992.00000 -9.618163543E-06 -9.696518247E-06  4.080694570E-06  7.874673573E-06
   -991.00000 -8.767387663E-06 -1.012196928E-05  3.827322982E-06  6.315202077E-06
   -990.00000 -8.083181010E-06 -9.635894264E-06  3.049519176E-06  5.302908607E-06
   -989.00000 -6.767527992E-06 -8.787573767E-06  2.230010837E-06  4.817300527E-06
   -988.00000 -4.968246898E-06 -8.254624823E-06  1.540853782E-06  4.667945882E-06
   -987.00000 -3.046038369E-06 -8.166135596E-06  1.028297048E-06  4.730444119E-06
   -986.00000 -1.166755532E-06 -8.469415398E-06  7.338287121E-07  4.901384390E-06

计算完成后先确认关联函数是否收敛,将 spec.tvcf.ft.dat 拖入origin中,选择第一列和第二列作图:

../_images/fig5.2-12.png

随时间趋于0表示吸收光谱计算收敛。选择第一列和第四列作图:

../_images/fig5.2-13.png

随时间趋于0表示发射光谱计算收敛。

spec.tvcf.spec.dat 为光谱文件:

   #spectrum
#1Energy(Hartree)       2Energy(eV) 3WaveNumber(cm-1)   4WaveLength(nm)           5FC_abs           6FC_emi 7FC_emi_intensity
   1.63970997E-05    4.46187977E-04    3.59874741E+00    2.77874462E+06    2.22315237E-05    1.35978424E-12    5.71912365E-20
   9.23885920E-05    2.51402258E-03    2.02769521E+01    4.93170766E+05    1.24781305E-04    2.44296355E-10    5.78932299E-17
   1.68380084E-04    4.58185718E-03    3.69551568E+01    2.70598229E+05    2.26516688E-04    1.48614131E-09    6.41864375E-16
   2.44371577E-04    6.64969178E-03    5.36333615E+01    1.86451114E+05    3.27482697E-04    4.56299919E-09    2.86018106E-15
   3.20363069E-04    8.71752639E-03    7.03115662E+01    1.42224111E+05    4.27602118E-04    1.03315707E-08    8.48987397E-15
   3.96354561E-04    1.07853610E-02    8.69897710E+01    1.14956045E+05    5.27021609E-04    1.96507539E-08    1.99781616E-14
   4.72346054E-04    1.28531956E-02    1.03667976E+02    9.64618045E+04    6.25550501E-04    3.34234748E-08    4.04952733E-14
   5.48337546E-04    1.49210302E-02    1.20346180E+02    8.30936218E+04    7.23426877E-04    5.25150757E-08    7.38625716E-14
   6.24329038E-04    1.69888648E-02    1.37024385E+02    7.29797108E+04    8.20443555E-04    7.78979043E-08    1.24747472E-13
   7.00320530E-04    1.90566994E-02    1.53702590E+02    6.50607125E+04    9.16771962E-04    1.10429551E-07    1.98369368E-13
   7.76312023E-04    2.11245340E-02    1.70380794E+02    5.86920611E+04    1.01226209E-03    1.51170543E-07    3.01020401E-13
   8.52303515E-04    2.31923686E-02    1.87058999E+02    5.34590693E+04    1.10713559E-03    2.00942496E-07    4.39297283E-13
   9.28295007E-04    2.52602032E-02    2.03737204E+02    4.90828371E+04    1.20107277E-03    2.60943515E-07    6.21333781E-13
   1.00428650E-03    2.73280378E-02    2.20415409E+02    4.53688790E+04    1.29454751E-03    3.31900017E-07    8.54982733E-13
   1.08027799E-03    2.93958724E-02    2.37093613E+02    4.21774330E+04    1.38703730E-03    4.15196637E-07    1.15048722E-12

spec.tvcf.spec.dat 拖入origin中,选择第三列和第五列作图,得到吸收光谱:

../_images/fig5.2-14.png

选择第三列和第六列作图,得到发射光谱:

../_images/fig5.2-15.png

打开spec.tvcf.log,文件末尾输出了荧光辐射速率值,

radiative rate     (0):     7.21227543E-12    2.98165371E+05 /s,    3353.84 ns

荧光辐射速率在第一个数和第二个数读取,单位分别为a.u.和 \(s^{-1}\) ,第三个数为寿命,单位为ns。这里,azulene的S1→S0的荧光辐射速率为 2.98165371E+05 /s,荧光寿命为3353.84 ns。

接下来计算azulene的内转换速率。第一步为EVC振动分析计算。

内转换速率的EVC振动分析计算需要非绝热耦合计算结果文件。将非绝热耦合计算结果文件改名为 azulene-nacme.out ,与 azulene-s0.outazulene-s1.out 放在内转换速率计算文件夹下,输入文件 momap.inp 为:

do_evc          = 1

&evc
  ffreq(1)      = "azulene-s0.log"
  ffreq(2)      = "azulene-s1.log"
  fnacme        = "azulene-nacme.log"
  proj_reorg = .t.
/

提交脚本文件 momap.slurm ,任务计算结束后,生成如下文件:

../_images/fig5.2-16.png

与前述荧光辐射速率的evc计算相比,多出一个 evc.cart.nac 文件,该文件将和 evc.cart.dat 文件一起用于接下来的内转换速率的计算。

内转换速率输入文件 momap.inp 为:

do_ic_tvcf_ft   = 1
do_ic_tvcf_spec = 1

&ic_tvcf
  DUSHIN        = .t.
  Temp          = 300 K
  tmax          = 1000 fs
  dt            = 1   fs
  Ead           = 0.07502 au
  FreqScale     = 0.40
  DSFile        = "evc.cart.dat"
  CoulFile      = "evc.cart.nac"
  Emax          = 0.3 au
  logFile       = "ic.tvcf.log"
  FtFile        = "ic.tvcf.ft.dat"
  FoFile        = "ic.tvcf.fo.dat"
/

计算结束后,生成文件如下:

../_images/fig5.2-17.png

其中 ic.tvcf.ft.dat 为关联函数文件,内容如下:

  #time(fs)          IC_ft_Re(au)      IC_ft_Im(au)
-1000.00000      -0.302000787E-13   0.332374045E-13
 -999.00000      -0.205081112E-13   0.364896559E-13
 -998.00000      -0.114899559E-13   0.364092975E-13
 -997.00000      -0.403418594E-14   0.342290784E-13
 -996.00000       0.187447714E-14   0.309462504E-13
 -995.00000       0.652215564E-14   0.270373111E-13
 -994.00000       0.100875106E-13   0.226564272E-13
 -993.00000       0.125729252E-13   0.178887681E-13
 -992.00000       0.138917246E-13   0.128953745E-13
 -991.00000       0.139788795E-13   0.793558174E-14
 -990.00000       0.128516224E-13   0.332590373E-14
 -989.00000       0.106275531E-13  -0.595694484E-15
 -988.00000       0.755502051E-14  -0.349394006E-14
 -987.00000       0.406056718E-14  -0.511604680E-14
 -986.00000       0.703538619E-15  -0.544879345E-14
 -985.00000      -0.203569213E-14  -0.479493437E-14

计算结束后首先确认关联函数是否收敛,将 ic.tvcf.ft.dat 拖入origin中,选择第一列和第二列作图:

../_images/fig5.2-18.png

随时间趋于0表示关联函数收敛。

其中 ic.tvcf.fo.dat 为谱函数文件,内容如下:

#1Energy(Hartree)       2Energy(eV) 3WaveNumber(cm-1)   4WaveLength(nm)    5radi-spectrum      6kic(s^{-1})         7log(kic)
   0.00000000E+00    0.00000000E+00    0.00000000E+00          Infinity    0.42121076E-05    0.17413431E+12    0.11240884E+02
   0.75991492E-04    0.20678346E-02    0.16678205E+02    0.59958492E+06    0.44127214E-05    0.18242796E+12    0.11261091E+02
   0.15198298E-03    0.41356692E-02    0.33356409E+02    0.29979246E+06    0.46209108E-05    0.19103480E+12    0.11281112E+02
   0.22797448E-03    0.62035038E-02    0.50034614E+02    0.19986164E+06    0.48375050E-05    0.19998910E+12    0.11301006E+02
   0.30396597E-03    0.82713384E-02    0.66712819E+02    0.14989623E+06    0.50633471E-05    0.20932572E+12    0.11320823E+02
   0.37995746E-03    0.10339173E-01    0.83391024E+02    0.11991698E+06    0.52978153E-05    0.21901896E+12    0.11340482E+02
   0.45594895E-03    0.12407008E-01    0.10006923E+03    0.99930820E+05    0.55357841E-05    0.22885692E+12    0.11359564E+02
   0.53194045E-03    0.14474842E-01    0.11674743E+03    0.85654988E+05    0.57737058E-05    0.23869293E+12    0.11377840E+02
   0.60793194E-03    0.16542677E-01    0.13342564E+03    0.74948115E+05    0.60096238E-05    0.24844610E+12    0.11395232E+02

为检查是否满足能隙定律,将 ic.tvcf.fo.dat 拖入origin中,选择第三列和第七列作图:

../_images/fig5.2-19.png

此外, ic.tvcf.fo.dat 文件中第一列和第六列表示不同Ead下的非辐射速率。

ic.tvcf.log 文件的末尾,读取S1→S0的非辐射速率值,

 #1Energy(Hartree)       2Energy(eV) 3WaveNumber(cm-1)   4WaveLength(nm)    5radi-spectrum      6kic(s^{-1})         7log(kic)         8time(ps)
7.50036029E-02    2.04095275E+00    1.64613880E+04    6.07482186E+02    6.54396018E-07    2.70536301E+10    1.04322255E+01       36.96361624

这里S1→S0的非辐射速率为2.70536301E+10 \(s^{-1}\)

对比azulene的荧光辐射速率和非辐射速率,荧光辐射速率为2.98165371E+05 /s,非辐射速率为2.70536301E+10 \(s^{-1}\) ,非辐射速率比荧光辐射速率高五个数量级,从而降低了azulene的S1→S0的荧光量子效率,所以S1→S0的荧光难以被观测到,从而表现出反kasha规则的荧光现象。